据考古发现，约6000年前先民们已在九峰一带生息。秦时，本县地属会稽郡的长水县（秦末改名由拳县）东境、海盐县北境、娄县（后改昆山县）南境。唐天宝十年（751年），吴郡太守赵居贞奏请划本郡昆山南境、嘉兴东境、海盐北境之地，置华亭县。元代升府后，从华亭县中先后析建上海、青浦等县。清顺治十三年（1656年），分华亭县西北部重建娄县。民国初，华亭、娄县合并，改名松江县。此后，本县和金山、青浦等县曾调整部分辖区，但疆域基本稳定。

县以下行政区划也屡经变化。唐时华亭县辖22乡，至清末，华亭、娄两县所辖仅有原8个乡的一部分。民国元年（1912年）本县下辖24市、乡。1949年解放前夕为20乡镇。1949年11月，全县划分为10区，1957年撤区并乡，设4镇、17乡（旋改为公社）。1966年和金山县调整部分辖区后改为13公社、2镇。1985年全县设2镇、19乡。