畜禽和水产养殖、海洋及内河捕捞是南汇县的传统副业，主要产品为肉猪、肉禽、蛋、奶、鱼(淡水养殖鱼为主，捕捞鱼为辅；内河鱼为主，海鱼为辅)以及羊、兔、鸽、蜂等，其中瘦肉型“供港”猪、肉禽、鸡蛋和鲜活蜂皇浆是南汇县农业出口创汇的重要商品。畜牧水产业的年产值从1989年起即占到南汇县农业总产值的一半以上，被作为衡量南汇县农业生产水平的重要指标之一。根据市场需求，扩大畜牧水产业的生产规模、提高生产水平，是增加农民收入的重要途径之一。

    1986～2001年，南汇县的畜牧水产业在改革开放不断深入和社会主义市场经济逐步形成的形势下，不断深化管理体制的改革，坚持以市场为导向，发展生产为基础，提高产品质量和经济效益为目标，不断提高行业的市场化、产业化、科技化、法制化程度，为国内市场和出口创汇提供越来越多的安全、卫生的优质产品，切实保证上海市人民政府“菜篮子工程”在南汇县的贯彻实施。2001年，根据市发展规划及南汇城市化进程，南汇县对畜牧业的发展规划作出适度调整：“减猪禽，稳蛋，适度发展奶牛、肉(用)牛、羊等食草动物，大力发展特种养殖和出口创汇产品。”

2001年，南汇县畜牧业和渔业的产值分别为87986万元和14016万元，较1985年的24194万元和4792万元分别增加2.64倍和1.92倍。

1985年～2001年畜牧水产业产值情况表

单位：万元（1990年不变价）

年份	农业总产值	牧、渔业产值			在农业总产值中所占%
		合计	牧业	渔业
1985	64241	28986	24194	4792	45
1986	66090	32677	27067	5610	49.44
1987	71874	34015	27468	6547	47.33
1988	75987	35671	27569	8102	46.94
1989	75383	40220	31058	9162	53.35
1990	81112	43155	33940	9215	53.20
1991	85421	48600	37996	10604	56.89
1992	98061	50681	40057	10624	54.46
1993	98948	56358	45790	10568	56.96
1994	116319	67989	56054	11935	58.45
1995	128278	77260	65653	11607	60.23
1996	140544	83270	70724	12546	59.25
1997	155272	92979	78485	14494	59.88
1998	168135	93420	80448	12972	55.56
1999	174797	95900	82459	13440	54.86
2000	184458	98560	85110	13450	53.43
2001	196149	102002	87986	14016	52.00