民国时期，本县流行的传染病有霍乱、天花、狂犬病、乙型脑炎、麻疹、伤寒、白喉、结核病等，前5种尤为严重。据报载资料，民国8年(1919年)至35年，遍及全县的霍乱大流行有10次。8年秋，朱家角镇在1个月内因患霍乱病而死亡的有百余人。民国26年统计，练塘地区有幼儿之家，十有八九患天花。25年春，城厢、朱家角、练塘等地发生流行性乙型脑炎。35年春，朱家角、金泽、崧泽等地流行麻疹，患者百余。青浦县卫生院等医疗机构开展预防接种，种牛痘4300多人次，注射霍乱、伤寒等疫苗72750多人次。

解放后，按照“预防为主”的方针，在全县城乡推行计划免疫接种，建立法定传染病报告制度和加强消毒，传染病发病率明显下降。据1952至1985年33年的统计，全县报告20种急性传染病共19万例。50年代报告36928例，年发病率为10万分之1581；60年代报告88797例，年发病率为10万分之2026；70年代报告28550例，年发病率为10万分之704；1980至1985年报告35676例，年发病率为10万分之1330。20种急性传染病中，天花、白喉、脊髓灰质炎等7种疾病已经消灭，麻疹等8种疾病已得到控制。50年代以麻疹、流行性感冒、白喉等呼吸系统疾病为多。进入80年代，痢疾、病毒性肝炎等肠道疾病占一、二位。