明、清时代的县政权由知县、县丞、主簿、典史等官员组成。知县为七品，总揽全县政事，是最高行政长官。县丞为八品，主簿为九品，分掌粮马、征税、户籍、巡捕之事。典史未入流，以掌狱囚。儒学教逾、儒学训导共同负责县学的管理及课业。僧会司、道会司分管佛道。在朱家角、章堰、诸翟镇分别设立巡检。署衙还有吏、户、礼、兵、刑、工六房，负责民政、人事、武备、司法、工商等项，六房之外设壮班、皂班、快班、捕班等若干差役，设总头一人，称“四班总头”。

乡为基层政权，设乡董、议事等，有几家小店的集地称为市或镇。乡以下为保，保下设区，区下设图，每保设保正、每图设图正各1人，为地方行政官佐。

宣统元年（1909年），清政府颁布《府厅州县地方自治》，实行自治新制。二年，改乡为区制，全县划分16自治区，每区设区董1人，掌管地方自治之事。区以下建市、乡自治：设市、乡公所及议事会、董事会，有议长、副议长及乡董、乡佐等，乡辖村镇自治。以5家为邻，有邻长1人；5邻（25户）为闾，有闾长1人；100户为村，每村公举正副村长各1人，设村公所，为自治机构，村长为自治首领，闾邻长辅之，负责办理本乡（村）行政事宜。同年，县成立农会分会。三年，设县议事会、参事会。另外，在朱家角、青浦、重固、金泽等镇分别设立商务分会，在商榻三官堂、黄渡、金泽设立征局各1所。还设置青浦巡警教练所、朱家角邮政局、禁烟分所、课桑局等事务机构，分管商务、课征、巡警、邮政、禁烟、课桑等事。