民国时期，本县无渔业管理机构。抗战胜利后，国民政府于民国35年(1946年)颁发《渔业法》。同年，江苏省政府制订《渔业法施行规定》40条。县政府根据《渔业法》和《渔业法施行规定》于是年12月27日开始实行“渔业证”制度。规定凡从事渔业生产的渔民须申请领取《渔业生产许可证》，缴纳渔业登记费后方可进行捕捞生产。与此同时，县成立渔会，具体负责办理渔业登记、处理渔农纠纷等事宜。

解放后，渔业管理先后由县人民政府生建科、农林科和农业科兼管。1958年，县成立畜牧水产局后，由水产股专管。1982年5月1日，市人民政府颁发《上海市水产养殖保护暂行规定》和《实施细则》。同年6月3日成立青浦县渔政管理站，为渔业专职管理机构。