青浦东西两部构成的不同地貌，支配了县境内水系的流向和格局，奠定了土壤的形成、发育和分布的基础。母质类型有湖泊沉积、江海沉积、交互沉积和回流沉积等多种，又经历了盐渍化，沼泽潜育化、草甸土等自然成土过程及长期的耕种熟化，形成各类耕种土壤。全县土壤主要有青黄土、青紫土等土属。由于本县种稻历史悠久，对土壤发育有影响，形成以水稻土为代表的土壤类型，水稻土占耕地总面积的95.6％。其中青黄泥、青黄土、青紫泥三个土属，占水稻土总面积的75.8％。土壤中有机质含量丰富，全县平均2.96%±0.55％；全氮和全钾含量较高，平均分别为0.182%±0.031％和1.95％±0.2％；有效磷含量低，全磷含量平均0.072％±0.013％；速效磷含量平均13.2ppm±7.18ppm，土壤呈中性或中性偏碱反应。耕层较深，4寸至5寸以上占72.2％，土壤代换性能较好，14—20毫克当量的占72.3%。

东部碟缘地段母质以江海沉积物为主，高平田有青黄土、黄潮泥，兼有黄泥头、沟干泥。地面高程在3.6—4.8米之间稳定地下水位埋深在1.2米以下，土壤有机质含量为2.5％左右。碟坡地段母质除江海沉积物外，河湖交互沉积物或湖相沉积物也相间存在。地面高程在3.2—3.5米之间。除青黄土属外，并有青紫土、青紫头和青紫泥，有机质平均含量为2.9％。腹部洼地地面高程仅2.2—2.8米，潜水位较高，土壤通透性差，有机质平均含量高达3.84％，以青紫泥和青泥土为主。

西部低洼荡地与低洼泖田的交互地段，母质受潮汐回流物覆盖，河流冲积物有所分布。土壤有青黄泥、青黄土、青紫泥、青泥土和小粉土等。地面高程在2.8—3.5米之间，土壤有机质含量为3.02％，形成复杂的土被结构。入泖荡圩田，地面高程仅2.2—2.8米，有机质含量为2.67％，受泖河影响，土壤以小粉土、青紫土为主。最西部为岛状地形土壤分布区，有青黄泥、小粉土、青紫泥、青泥土等，也有青黄土相间分布。青西地区由北向南土壤粗粉粒含量逐渐增加，有机质含量由2.57％增至2.94％。腹部地区土壤质地由粗粉质中壤土逐渐演变为粗粉质重壤土或粉质粘土。