1276年(元至元十三年)，本县已有沙船航行北方沿海。1282年(元至元十九年)，西沙人朱清和嘉定人张瑄率平底沙船60艘运粮6000余石经海道至直沽(今天津)达京师(今北京)，船队由刘家港入海。直至会通河修成改为漕运，结束海运。1639年(明崇祯十二年)崇籍人沈廷扬(时任武英殿中书舍人)上书朝廷建议恢复海运。近代，本县货运船舶以航行江南为主。解放前夕仅限于崇沪之间。解放后，水上货运发展至长江沿线和浙江沿海，县内内河货运有较大发展。