本县通航港口有南沿、北沿之分。解放时，南部沿江主要通航港口有海洪港、庙港、　鸪港、施翘河、南门港、二条竖河、新河港、堡镇港、四滧港、六滧港、七滧港、奚家港；北部沿江主要通航港口有上白港、上小竖河、老滧港、湾港、相见港、富民港、北四滧。解放战争期间，国民党政府出于军事需要，除施翘河、新河港、堡镇港、湾港外，其余港口曾一度封闭。

解放初，港口大部恢复通航。1956年起经过兴修水利，整治河道，并港建闸，港口有所变动。1984年，本县南沿通航港口有新建港、庙港、鸽龙港、三沙洪、南门港、老滧港、东平河、新河港、堡镇新港、六滧港、奚家港11个港口，可通航60吨级至150吨级船舶；北沿通航港口有界河、鸽龙北港和堡镇北港3个港口，可通航60吨级至100吨级船舶。

南沿主要通航港口变迁表

名称	现址	建废时间	通航能力
海洪港	三星乡	1962年淤浅封闭	靠泊20吨船舶
庙港	庙镇乡	1956年经改造扩建通航至1984年	通航150吨船舶
鸪港	庙镇乡	1956年并港时封闭	靠泊20吨船舶
施翘河 （后称三沙洪）	城桥乡	1957年经改造扩建通航至1984年	通航150吨船舶
南门港	城桥镇	1957年并港时封闭，1962年另建通航至1984年
二条竖河	鳌山乡	1957年并港时封闭	靠泊20吨船舶
新河港	新河乡	1958年经改造扩建通航至1984年	通航60吨船舶
堡镇新港	堡镇镇	1957年在原有港口西侧另建港口通航至1984年	通航100吨船舶
四滧港	五滧乡	1957年并港时封闭	靠泊20吨船舶
六滧港	向化乡	1958年建闸后断航，1966年改建后通航至1984年	通航100吨船舶
七滧港	汲浜乡	1957年并港时封闭	靠泊20吨船舶
奚家港	陈家镇乡	1958年经改造扩建通航至1984年	通航100吨船舶
仓房港	三星乡	1958年建闸后断航，1966年改建为通航水闸，1972年堵坝封闭
鸽龙港	江口乡	1961年建港通航至1984年	通航150吨船舶
东平河	鳌山乡	1961年建港通航至1984年	通航150吨船舶
老滧港	鳌山乡	1980年建港通航至1984年	通航150吨船舶
新建港	绿华公司	1972年建港通航至1984年	通航150吨船舶

北沿主要通航港口变迁表

名称	现址	建废时间	通航能力
上白港	新海农场	1956年并港时封闭	靠泊20吨船舶
上小竖河		1956年并港时封闭	靠泊20吨船舶
老滧港	东风农场	1956年并港时封闭	靠泊20吨船舶
湾港	东风农场	1956年并港时封闭	靠泊20吨船舶
相见港	前进农场	1956年并港时封闭	靠泊20吨船舶
富民港	富民农场	1956年并港时封闭	靠泊20吨船舶
北四滧	合兴乡	1956年并港时封闭，1964年重建，1979年停航	通航60吨船舶
界河	新村乡	1972年建港通航至1984年	通航60吨船舶
北鸽龙港	永隆沙	1978年建港通航至1984年	通航100吨船舶
堡镇北港	港沿乡	1979年建港通航至1984年	通航100吨船舶