该行业包括基本化学原料、化学肥料制造，合成材料及日用化学产品制造等业。本县化学工业兴起于1959年。是年，各人民公社因陋就简兴办土化肥、土农药等小型社办厂，当年产值33.26万元。1960年崇明化肥厂建成投产，1962年生产合成氨857吨。70年代初期，新民化工厂、竖河造漆厂等企业相继创办，1984年，全县从事本行业生产的企业共有16个，其中县属企业3个、乡村企业13个，职工共1583名，年末固定资产原值498.2万元，总产值1492.9万元，利税总额286.9万元。主要产品产量为：油漆149.44吨、合成氨23298吨、氧气339.5千立方、农用化肥(折合N₂100％计算)16072吨。其他产品还有鞋油、牙膏等日用化工用品。