县良种场于1966年初建立，位于东平农场北沿堤外，占地3028亩。该场属县领导，由县委农村政治部管理。1966年，植棉2700亩，皮棉总产13.6万斤。1970年1月，市农业科学研究院崇明地区试验站、县合兴良种繁育场、县种畜场并入该场，职工总数由
1966年的32名增加到157名，其中科技人员14名。业务范围逐步转入以“三圃”为主。良种场为全县主要农作物的品种更新提供种源，选育、繁殖、试验和示范推广良种、良法。1976年4月，抽调人员和划出部分土地另建县农科所。同年，县种畜场迁出。1979年，县农科所迁出。1981年2月，县良种场更名为县农业良种繁育场。1984年，全场共有耕地1931亩，干部职工422名，其中科技人员12名。
70年代，该场自行选育推广10余个稻、麦、棉新品种(品系)；80年代育出崇抗55抗病棉新品种。1966年至1984年，共提供三麦良种289.43万斤、水稻良种906.4万斤、玉米良种15.48万斤、棉花良种138.52万斤。
