崇明岛地势坦荡低平，岛上无山岗丘陵。地面高程标高3.21—4.20米（以吴淞为0米）占总耕地的90.65％；低洼地标高在3.20米以下，占总耕地的3.48％；高亢地标高在4.21米以上，占总耕地的5.87％。海堤和河岸两旁堆叠土标高则在6.0米以上，占总面积的1.38％。

岛上地形总趋势是西北部和中部稍高，西南部和东部略低。新村乡、新海农场北部、红星农场南部、长征农场东部、长江农场中部、永隆沙、虹桥垦区、建设乡中部和北部、新民乡东北和东南部、大新乡北部、竖河乡中部和东北部、大同乡东南部、东平河口两侧、港沿乡北部及五滧乡中部等地区，地面标高均在4米以上。界河口两侧、鸽龙港北口西侧、东平河河口东侧，部分地面标高超过4.5米。海桥、合作、三星乡北部和西南部、庙镇乡、江口乡南部、小竖河两侧、城桥乡东北部和南部、鳌山乡南部、向化乡东北部、汲浜乡西北部、裕安陈家镇两乡东南部、前哨农场、陈家镇乡和五滧垦区的地面标高在3.5米以下。地面标高3.2米以下的低洼地区分布在裕安乡北部、张网港口两侧，局部洼地地面标高低于3.0米。

［崇明地势图］

耕地地面高程表

地面高程（吴淞0米）	占总耕地比例（％）
2.80米以下	0.39
2.80—3.00	0.53
3.01—3.20	2.56
3.21—3.40	11.82
3.41—3.60	25.53
3.61—3.80	25.76
3.81—4.00	17.97
4.01—4.20	9.57
4.21—4.40	3.34
4.41—4.60	0.93
4.61—4.80	0.43
4.81—5.00	0.27
5.01—5.50	0.37
5.51—6.00	0.21
6.01米以上	0.32
合计	100.00