1956年2月，正式建立中国人民政治协商会议南汇县委员会，设主席、副主席、秘书长和常务委员，主席由中共南汇县委书记兼任。下设学习委员会和工商、文教、卫生、社会4个工作组，学习和宣传民族政策、宗教政策、侨务政策、统一战线政策。“文化大革命”中，政协机构被污蔑为“牛鬼蛇神大本营”，被迫停止活动。中共十一届三中全会以后，经过拨乱反正，1981年9月，举行南汇县政协四届一次全体会议，县政协恢复活动。下设文教、卫生、工业、农业、工商等工作组。1984年4月五届一次会议后，下设学习委员会、提案工作委员会和教育、卫生、工交、财贸、文体、农业、科技、民族宗教、祖国统一、工商、文史资料等11个工作组，及按地区编组的9个学习组。从此，政协组织得到了进一步健全。