本县属黄浦江水系，为平原河网感潮区，河港纵横交叉，境内水系发达，淡水资源丰富，据多年的检测，年平均地表水资源总量可达18.59亿立方米（其中天然径流2.10亿立方米，可引潮量16.49亿立方米）。但年间的变化较大，季节分配上不平衡，因此，本县拓河、疏浚、筑坝、建闸等水利工程任务繁重。

覆盖于本县地区最上部的地层都为全新世晚期滨海相潜水含水层，含水层顶的埋深为3－4米。由于其顶部没有不透水的覆盖层，因此受地表降雨量、蒸发量、潮水位、人为排灌等许多自然因素和人为因素变化的影响甚大。