本县境内河流稠密，水面积约占总面积的7.5％。全县有骨干河道25条，总长247.43公里。其中东西向的有8条﹕自南而北有走马塘、蕴藻浜、沙浦、湄浦、马路河、练祁河、顾泾、新川沙河；南北向的有16条﹕在蕴藻浜以北自东而西有随塘河、北泗塘、杨盛河、潘泾、荻泾、界泾、杨泾7条，在蕴藻浜以南的有小吉浦、郝桥港、沙泾港、俞泾浦(芦泾浦)、西泗塘、东高泾、彭越浦、西弥浦、桃浦9条。在县境东南还有一条环状河外走马塘，大部分系自然形成，少数为人工开挖。全县有支河888条，总长965.94公里。其中乡级河124条，总长286.44公里，村级河764条，总长679.5公里。长兴、横沙两岛有主要河道12条。县境河道由于长江来水每日两潮挟带泥沙以及雨水冲刷等自然因素，容易淤塞，历来对疏浚极为重视。马路河、走马塘等干河，明嘉靖、万历以来三四百年间，各疏浚达30次左右。解放以来，疏浚干河106条(段)次，总长518.41公里，挖土2648.3万立方米。建造配套桥梁325座，建控制闸43座。加上施工中的房屋迁建等，国家共投资2052.14万元。