吴淞区建立以来，作为市的区，属非一级财政收支单位，长期处于收入统一上缴，支出由市财政拨款的状态。1982年以后正式建立区级财政，区财政逐步增加自有的调控能力，有利于区建设事业的发展。

吴淞为上海市的水陆运输要口，历来中央和市许多征税部门均在此设点征收，直至1950年成立区税务分局后，才有统一的征税机构。税收为吴淞区的主要收入，1987年达到3亿多元，绝大部分上交市财政，为社会主义建设积累资金。