境内苗圃始于清光绪十四年(1888年),邑人陆永茂在今方浜路开办私人花圃6亩。同年秋,在老西门方斜路一带形成花树市场。不久,陆永茂又和顾义和等人发起组织花树事业同业公所。民国17年(1928年),区内建有花神宝殿(即花神庙),至民国26年,因抗战爆发而中止。

    1958年,邑庙区在虹桥路1251号设公私合营陈全福苗圃,占地1.66公顷;邑庙区财贸系统在青浦方家窑建南崧农场,划出13.33公顷土地办南崧苗圃。蓬莱区在天山路曹家宅35号设公私合营徐森林苗圃,面积1.04公顷,区建设科在奉贤新寺公社办蓬莱苗圃,面积33.33公顷。1960年,上述4个苗圃均划属南市区建设科。1961年、1963年蓬莱苗圃和南崧苗圃先后撤销。1964年,陈全福、徐森林苗圃划归上海花圃。

    1974年,在桃源新村划出0.1公顷空地办苗圃,1991年划归江阴街花店。1977年,设于川沙县三岔港的南市区“五七”干校撤销,划出4公顷土地,加上南市区房产局绿化灭蚁所调给的2.66公顷土地,建立三岔港苗圃。1981年4月,该苗圃移交市行道树养护队。

    抗日战争前,境内花木店摊主要集中在城隍庙百翎路一带。花店花摊,供应花卉、盆栽植物,腊月时出售天竹、腊梅、水仙、万年青等陈设植物,作为有些家庭的岁朝清供。抗日战争时,城隍庙沦为难民区,花木动物店摊大多停止营业。抗战胜利后迅速恢复。解放后,花木业逐步衰落,至社会主义改造时,老城隍庙市场仅剩花店1户。区园林所在南车站路开设花卉、树苗店,供应单位绿化。中共十一届三中全会后,花卉业恢复发展,至1992年,境内有花店17家,经营花卉盆景、鲜花、树苗等业务。