1949年6月10日,市公安局发布命令,解除原警察分局正副分局长职务,同时任命公安分局正副分局长。邑庙、蓬莱分局正式成立。局内均设治安、司法、户籍、供管、秘书5股。邑庙分局在方浜中路59号,下辖福佑路、蔓笠桥、露香园3个派出所；蓬莱分局在蓬莱路171号,下辖直辖、南阳桥、沪军营、董家渡、陈家桥、巡道街6个派出所。1950年2月,两个分局各增设第六股。1950年3月～1951年5月,邑庙分局增设小东门、金家坊、沉香阁3个派出所,组建勤务中队；蓬莱分局增设三官堂、关桥、中华路3个派出所；1952年7月,各分局改设政保、治安、户籍、政工4科和办公室。同年10月,邑庙分局迁址人民路841号新楼。1952年12月～1955年9月,邑庙分局增设方浜中路、丹风路、西马街、人民路、果育堂街(广福寺)、城隍庙、十六铺、太平东村8个派出所；蓬莱分局增设迎勋路、文庙路、大吉路、王家码头、保安路、国货路、西仓路、唐家湾、制造局路、斜桥、南京街、普育西路、小普陀桥、大东门、阜民路、小南门、中华路、生义码头、车站路、大林路、高昌庙21个派出所。1953年1月,各分局的政工科改称协理员办公室,蓬莱分局设经保科。1954年4月,增设文保、侦审、行政3科。1955年2月,2个分局调整机构后的科室顺序为:办公室、协理员办公室、政保科、经保科、文保科、刑侦队、预审科、治安科、户籍科、行政科。

    1956年3月区划调整,原嵩山分局所属连云路、龙门路、崇德路、黄陂南路、济南路、吉安路、金陵东路、云南南路、嵩山路、普安路、西藏南路、兴业路及人民游乐场13个派出所划归邑庙分局。邑庙分局迁址淮海中路235号。同年4月,邑庙分局撤并5个派出所,蓬莱分局撤并6个派出所。8月,派出所辖区扩大,邑庙、蓬莱分局分别撤并派出所5个和7个。10月,两分局协理员办公室改为政治处。1958年2月,两分局机构再次调整,分局设政保、治安、预审、总务科和政治处、办公室、交通队；并各撤并派出所8个,各留9个派出所。1959年12月,邑庙、蓬莱分局撤销。原邑庙分局所辖小东门、城隍庙、广福寺、露香园4个派出所及西藏南路、黄陂南路2个派出所的部分辖区与原蓬莱分局合并为南市分局。