解放初,国民党多次使用美制飞机空袭上海市区,南市多次被炸。其中,1949年8月3日轰炸江南造船厂,10月13日轰炸新开河、十六铺、白渡路江边地区,1950年1月25日、2月6日又连续空袭上海市区,南市区被炸毁房屋500余间,炸死居民168人、重伤157人。为抗御敌机空袭,邑庙、蓬莱两区于1950年2月分别建立区防空治安委员会,负责区内防空工作。1951年9月,改为区人民防空指挥部。1959年12月邑庙、蓬莱两区合并为南市区,人民防空机构也同时合并。1964年建立南市区人民防空委员会,下设办公室。1969年10月,改为区人民防空领导小组。1982年,恢复区人民防空委员会及其办公室。1986年2月,区人民防空委员会兼负抗震工作,人民防空办公室和抗震办公室“两块牌子,一套班子”,担任区防空和抗震双重任务。下辖单位有:南市区人民防空工程公司,辖3个工程队,有职工630人,为相对独立的生产经营性企业管理单位,南市区人民防空工程管理所,负责全区人防工事的维护管理、口部改道和工事的开发利用,有工作人员45人,属大集体事业单位;南市区人民防空(抗震)通讯站,现有工作人员4人,为全民事业单位。