解放初,邑庙、蓬莱两区接管委员会接收旧市政府两区区公所文书档案。1950年两区区政府秘书室管理档案。

    邑庙、蓬莱两区合并后,1960年4月建立中共南市区委、区人委机关联合档案室,统一管理区内档案,并负责全区档案工作的监督检查和业务指导。1964年建立南市区档案馆,隶属于中共南市区委办公室。

    1966年“文化大革命”开始,区档案工作机构瘫痪。1972年恢复档案馆,隶属区革命委员会办公室。

    1980年档案馆又隶属区委办公室。1986年建立区档案局,列入政府序列,实行档案局、档案馆合署办公,下设业务指导、档案管理、行政秘书3个组。全区有基层档案室150余个。