清咸丰三年(1853年)后，古镇经历多次战火洗劫，李泾失于疏浚，地理条件发生变化，景况日趋衰落。

    战争破坏 清咸丰三年，上海小刀会义军占领县城，并西进法华镇焚毁吴淞巡检司署。嗣后，上海知县率官兵在法华镇数次攻打小刀会义军，古镇首次遭到破坏。咸丰十年至同治元年(1860～1862年)，太平天国忠王李秀成率领太平军数次东征上海，部属进驻法华，在法华寺满月阁设立火药局，不慎爆炸，满月阁炸成焦土。团练法华局乘太平军撤出法华之机，进驻法华寺，并强令各团出30名团勇，镇民纷纷出走，人口大减。同治元年五至七月，清政府2次勾结洋人凭借洋枪火炮,在虹桥、七宝一带攻打太平军。法华镇风声鹤唳、草木皆兵，居民大批逃避至肇嘉浜、蒲汇塘一带。古刹香火中断，第宅园林、楼台亭阁逐渐颓废，商肆凋零，集市萧条。民国13年(1924年)9月，齐燮元、卢永祥军阀战争爆发，浙沪联军400余士兵进驻法华寺，士兵骚扰，集镇鸡犬不宁。民国26年八一三事变后，日本侵略军侵占法华地区，烧杀掳掠，无恶不作，法华镇又遭空前劫难，长达8年之久。

    河道淤塞 清乾隆十二年(1747年)至民国4年，大规模疏浚李泾12次，维护航运，保持法华地区经济文化的繁荣。嗣后，历经战乱，国弱民穷，政府不再出资疏浚，民间无钱募修，李泾长年得不到治理。加上两岸民宅住户倾倒垃圾，加速河床淤塞。河道航运不便，与外界交流逐步减弱，从此古镇逐渐衰落。民谣“龙华的桃子，法华的蚊子”，显示李 泾从龙华水蜜桃的集散通道,变成蚊子的孽生地。

    解放后，法华地区融入长宁区建设规划，得到彻底改造，走上欣欣向荣的发展道路。法华古镇仅是留在当地居民中一段古老的回忆。