中共十一届三中全会后,区内高等院校始建研究所,至1992年,高等院校自然科学类研究所共9家。

    一、中国纺织大学科研所

    1978年9月起,该校先后设立化纤研究所、纺织研究一所、纺织研究二所、纺织机械研究所和自动化计算机研究所。所址:设延安西路1882号楼内。

    1.化纤研究所

    1978年9月建所。设成纤工艺及理论研究室、高聚物结构性能研究室、化纤生产新仪器设备研究室。研究方向为化学纤维(或高分子材料)的结构和性质、化学纤维(或高分子材料)的成型理论工艺、化学纤维(或高分子材料)的物理化学改性；对高性能高分子纤维材料的研制。

    2.纺织研究一所

    1981年建所。设新型纺织研究室、织造研究室、浆料研究室、产业用纺织品研究室。研究方向为传统纺织工艺与设备及产品研究开发,新型纺织工艺与设备及产品研究开发,纺织结构复合材料的研究和产业用纺织品的研究开发。

    3.纺织研究二所

    1985年建所。所设研究室和研究项目均与纺织研究一所相同。

    4.纺织机械研究所

    1984年建所。设新型纺织机械研究室(一室)、新型织造机械研究室(二室)、综合服务研究室(三室)、振动噪声研究室(四室)、制造工艺研究室(五室)。研究方向为新型纺织机械。

    5.自动化及计算机研究所

    1991年建所。设计算机应用研究室、人工智能与机器人研究室、成套装置研究室、自动化研究室。研究方向为计算机网络、人工智能、自动控制、仪表检测等。

    二、上海纺织高等专科学校科研所

    所址:设长宁路1187号校内。1991年,成立应用技术研究所,在印染助剂、机织、染整工艺与设备、化纤工艺、服装设计、纺织仪器智能化、工业自动化控制工程等方面形成较强的研究、开发能力。

    三、上海工程技术大学科研所

    所址:设仙霞路350号校内。1990年、1992年,该校设立能源与环境工程研究所和激光工业技术研究所。

    1.能源与环境工程研究所

    1990年2月建所,研究方向为余热余能利用技术、基础理论及内部多相流研究；能源系统净化新技术及其应用基础研究；能源系统中的结构完整性、粒子冲蚀和腐蚀研究。

    2.激光工业技术研究所

    1992年建所,研究方向为激光加工研究及工业应用；激光加工机、激光医用仪、检测仪器研制；机电一体化装备的研制；激光与材料相互作用及材料表面改性的研究。

    四、上海市汽车运输科学研究所

    1979年,上海市交通运输局职工大学设立科研所,所址:新华路730号。下辖设计室、试验室、计算机室、交通工业产品质量监督站、计量站、业务部等部门,承担汽车改装设计,研制汽车保修设备,检测仪器设计,汽车道路性能设计,机械构件应力测试,汽车应用技术推广使用以及开发、培训、咨询服务。