一、上海市乳肉管理所

解放后，由市卫生局环境卫生处第八科对肉、乳等食品进行严格管理。1951年，以环境卫生处第八科为基础，组建上海市乳肉管理所，作为局属独立机构对外处理业务。建所时职工90人，至1955年增为450人。1956年，根据国务院《关于统一领导屠宰场及场内卫生及兽医工作的规定》，将检疫、检验工作划归市食品公司领导，驻场兽医卫检人员及仪器设备移交给屠宰场。所内先后设置肉品、乳品、蛋品、水产品及人畜共患病预防等5个管理组和微生物、理化检验室，设有化制站处理病死牲畜。1982年撤销建制，与市卫生防疫站合并。

二、上海市卫生防疫站

解放前，上海华界、租界均无专管卫生防疫的机构，其业务工作由各该卫生行政部门兼管。

解放后，1952年9月，市卫生局调派局卫生防疫处、生命统计室、卫生防疫队、卫生工程队及卫生试验所部分人员筹建市级卫生防疫机构。1953年1月5日，上海市卫生防疫站正式成立(简称市站)，负责全市卫生防疫行政管理和业务指导，站内设卫生防疫、检验、消毒及秘书科，职工243人。1953年，成立水上卫生防疫站，开展水上船民和航运系统卫生防疫工作，行政与业务由市站直接领导，1957年撤销建制。1959年，市站增设卫生宣教科、寄生虫病防治科、劳动卫生科、生命统计室、预防性卫生监督组、卫生防护组和人事科。1963年组建防疫大队，分成若干组常驻沿海副霍乱流行县。1966年6月全站职工916人。

“文化大革命”前期，仅留20余人维持日常业务。1968年12月，工、军宣队进驻后，按军队建制组成4个连队。1972年恢复原科室建制。1979年，卫生部颁发《全国卫生防疫站工作条例》，市站机构与业务得到恢复和加强。

1982年，市乳肉管理所并入，与食品卫生科组建成立上海市食品卫生监督检验所;市站进口粮食卫生检验组按全国统一建制改为中华人民共和国上海进口食品卫生检验所(1990年移交上海卫生检疫所)。改革开放后，卫生防疫工作不断扩大，业务科室相应发展。1988年，在中山西路1380号新建的1.9万平方米的卫生监测大楼落成，对外开展防疫、消毒、除害、计划免疫、劳动卫生、食品卫生、环境卫生、学校卫生、放射卫生、预防性卫生监督及理化检验、微生物检验等业务。1990年,全站职工692人,其中卫技人员490人，正副主任医师(技师)76人。