上海解放后，海运科技事业发展较快，至60年代初相继成立上海海运局热工试验站、上海海运局海运科学研究所、上海船舶运输科学研究所等专业科研机构，加上群众性科研和技术革新、技术革命活动的开展，逐步形成专业科研与群众性科技活动相结合的局面。

“文化大革命”中，专业科研工作一度中断，航海科研人员长期下放劳动，群众性科技活动亦受到冲击。中共十一届三中全会后，在改革开放方针的指引下，海运科技工作迅速恢复和发展。1978年始，上海海运局设科技办公室，负责本系统科技工作，制定历年科技计划及科技发展规划并组织实施；引进国内外先进技术和新工艺，为发展船舶运输生产及修船工业服务。进入80年代后，电子计算机等高新技术在上海海运系统得到开发和应用，同时，各种学术活动蓬勃掀起，群众性科技活动得以更加广泛开展。至1990年，大量科研成果运用于航海实践，对推动企业运输生产起到了积极作用。并有多项科研成果获部、市和国家级科技成果奖。