总厂财务管理实行一级法人、二级核算、三级管理（总厂、分厂、车间）、利润统缴的体制，按生产、基建两条线分别归口于总厂生产财务处和工程公司基建计划财务处（1985年更名为工程公司经营计划财务处），对二级单位财务履行指导、监督职责。建厂初期，经济上由国家统收统支，利润全部上缴国家财政部。
国家实行经济体制改革后，总厂作为全国大型企业扩大自主权的试点单位，试行“利润留成，超利分成”的制度。1983年以后，国营企业实行第一步、第二步利改税。其间，国家宏观经济三次调整紧缩。总厂审时度势，灵活应变，始终以市场为取向，提高经济效益为中心。1985年二期工程建成，已累计实现利税54.56亿元，除收回一、二期全部基建投资外，还多创利税8.27亿元。1976～1992年，总厂累计完成工业总产值416.60亿元，实现利税146.43亿元，其中利润88.80亿元，企业留利10.39亿元；1992年人均创利税2.29万元。1982年，“打击经济领域中严重犯罪活动”开展后，总厂经济监察工作逐步加强。1984年11月，为加强对总厂及二级单位财务收支及其经济效益的审计监督，总厂审计室成立。1989年4月，成立首家社会审计机构上海东华审计事务所金山卫分所，与总厂审计室互有侧重，互相补充，扩大了对总厂、地区经济审计的覆盖面。至1992年，全厂监察系统先后有19个单位被评为先进集体，42名干部被评为先进个人（其中4人被评为中国石化总公司优秀监察干部）。
