一、植物

上海成陆年代短，又经历了第四纪冰期、间冰期交替的5次海侵，特别是第五次海侵，植物区系、植物群落、植被类型都相对的比较简单。

自然植物群落。上海的植物区系属于泛北极植物区、中国—日本森林亚区、华东地区。它既有中国—日本森林亚区的许多特征，又有其本身的特点。上海的种子植物（包括外来归化野生草本和栽培林木）有1582种，隶属于169科、863属、其中裸子植物11科、28属、56种，被子植物158科、835属、1526种。上海植物区系成分中，有不少是构成本区地带性植被，常绿阔叶林、常绿落叶阔叶混交林的重要成分，主要分布于松江、青浦、金山等县的佘山、北干山、大金山等18个山丘，是上海唯一的自然林，反映上海地区自然植被类型。其种类主要有山毛榉科的青冈、木槠苦槠、白栎，樟科的香樟、红楠、山胡椒，山茶科的木荷、柃木，冬青科的冬青、构骨，胡桃科的化香椒、枫杨，榆科的榉树、白榆、榔榆，大戟科的野桐，禾本科竹亚科的毛竹、水竹、倭竹。裸子植物有马尾松、黑松、柳杉、杉木、水杉。草本植物群落以禾本科、莎草科、菊科的植物占优势，在沿海滩涂植被中藜科的植物占有相当的数量。

自然和半自然植物群落（指平原绿化，包括沿海、沿江的防护林以及滩涂的主要植被类型）。建国以来，开展平原绿化、进行农田林网和沿海、沿江防护林的建设取得一定成绩，对改善农业生态环境发挥了积极作用。但上海的森林覆盖率仅5.64％，明显低于全国森林覆盖率12.7％的水平，在全国大城市中也是最低的。其主要的种类有楝椒、嗅椿、刺槐、水杉、悬铃木、女贞、小蜡、珊瑚树。草本种类有芦竹、芦苇、海三棱、藨草等等。

栽培植物群落。上海绝大部分的面积为栽培植被。长期以来，郊县人民充分利用优越的自然条件和社会、经济条件，培育、繁殖了丰富多采的农作物品种资源。粮食作物有水稻的早稻、后季稻、单季晚稻，麦类的小麦、元麦、大麦和蚕豆、玉米等品种十分丰富，水稻有200多个品种，大麦有27个品种。上海蔬菜种类和品种之多居全国首位，现有栽培种分属于24个科、89种、400多个品种，其中仅豆类蔬菜就有200多个品种。瓜类资源也较丰富，有些还是著名特产。果树种类：较普遍栽种的有桃、梨、李、苹果、桔子、金桔、批把、葡萄、无花果等10多种，约45个品种。经济作物有棉花、油菜、大豆、花生、麻类、药材、香料、黄草、席草等种，品种也很丰富，其中棉花、花生各近10个品种，油菜10多个品种。

二、动物

上海因成陆时间短，动物区系、动物群落的数量和分布都比较简单，唯有水生动物资源相对比较丰富。根据对崧泽遗址中孢粉和马桥遗址中动物骨骼的分析鉴定，上海地区的脊椎动物有象、虎、豺、野猪、梅花鹿、麂、獐、獾、麋鹿（四不像）、水獭、穿山甲、龟、鳖、鲤等。

根据考古推测，距今6000年前，“冈身”以西崧泽遗址附近的松江佘山等地，都生长着茂密的针叶阔叶混交林。象、虎、豺、梅花鹿等野生动物栖息在茂密的山林或草丛里，水牛等大型动物栖息在水边，大象也常在这一带活动。麋鹿（四不像）、獾等动物在沼泽湿地草丛等生态环境中较为常见。水獭、龟、鳖、鲤等动物均以水为家。当时崧泽属古太湖区范围，水生动物种类较多，它们也是先民们的肉食来源之一。唐代以后，上海地区的山林已基本被毁，象、虎、野猪等大型动物也随之消失。但灌木草丛、沼泽湿地的小型动物，如獾、水獭、獐、麂、麋鹿（四不像）、刺猬、黄鼠狼等仍然存在，但数量不及以前，逐渐减少。到清代，上海地区的植被生态和动物分布基本趋于稳定，野生兽类仅剩下刺猬、黄鼠狼、猪獾、香灵猫、豹猫、獐、麂等的小型兽类。

进入20世纪以后，进一步开荒扩大耕地，原来的生态环境发生更大的变化，獐、麂等较大型的野生动物已完全绝迹。50年代后，上海地区又进行了大规模的平整土地、整治河道等生产建设活动，使不少野生动物因缺乏栖身之处而数量日趋减少，直至消失。野生脊椎动物资源的种类，据1986年不完全统计：淡水鱼类有中华鲟、白鲟、刀鱼、鲥鱼、长江银鱼、胭脂鱼、麦穗鱼、棒花鱼、松江鲈鱼等92种（约占全国800种的11％）；两栖类动物有大蟾蜍、黑斑蛙、金线蛙、虎纹蛙等13种（约占全国210种的6.18％）；爬行动物有平胸龟、大头乌龟、花龟、鳖等33种（约占全国320种的11.87％）；鸟类有红喉潜鸟、小鸊鷉、白额鹱、斑嘴鹈鹕、黄嘴白鹭、白琵鹭等386种（约占全国1186种的32.6％）；兽类有刺猬、棕蝠、黄鼬、短耳兔、社鼠等39种（约占全国450种的8.66％）。