解放前，上海仅有五洲固本皂药厂于民国22年(1933年)4月建立设计部，先后设计建成臭水、冷气、制粉和洗瓶等工场。是年，该厂从德国购进甘油制造设备，由柏林大学毕业回国的张辅忠设计完成国内第一个甘油生产工程项目。30～40年代，上海少数有机合成药厂根据生产需要，采取临时组织人员的办法，因陋就简地完成单项设计。解放后，为了发展医药工业，逐渐建立医药工程设计机构，形成一支设计队伍。1952年8月，上海青霉素实验所组建设计室，人员30～40人。1953年4月1日，在上海成立轻工业部设计公司华东分公司，人员100余人，其中有制药工艺科、设工艺、设备、上下水、暖风和机修等专业，人员30余人。1956年1月，制药工艺科全体人员迁至河北省石家庄市，组成轻工业部设计公司石家庄分公司，同年11月定名为化学工业部医药工业设计院。1956年后，上海一些药厂根据建设需要，自行组织力量开展设计工作，上海第二制药厂、上海第三制药厂、上海第四制药厂、上海葡萄糖厂等原料药生产厂成立设计组，人员几人至十几人，设计项目以本厂车间改造、扩建和新建为主。1957年9月至1958年6月，化学工业部医药工业设计院迁至上海，更名为化学工业部上海医药工业设计院。1958年8月，该院与上海市化学工业局所属的化工设计院合并，易名为上海化工医药设计院，承担化学工业、医药工业双重设计任务，人员504人，成为上海医药工程设计的主要专业设计单位。该院成立后，除了承担上海药厂的主要原料药工程设计项目外，还承担外省市医药骨干企业的工程设计项目。1960年起，上海医药工程专业设计单位开始承担授外医药项目的设计，第一个项目是该年末承担的蒙古人民共和国的畜用土霉素工程项目。60年代前后，上海技术力量较强的药厂设计组或临时组建的项目组完成了一批项目设计。但在1966年后的“文化大革命”中，设计机构大部被撤销，直到“文化大革命”结束，才纷纷恢复。70年代末，开始实行改革开放的方针，医药工程设计迅速发展。1979年11月30日，成立上海市医药工业公司建筑设计室，1980年定名为上海医药工业设计室，人员13人。药厂的设计能力也不断提高，1986、1987年，上海第三、四、六制药厂分别取得上海市医药管理局颁发的二类压力容器设计资格批准书。1988年11月，成立上海药化设计所，人员24人。80年代，按照规模经济的要求，上海专业医药设计单位的项目设计日趋大型化，设计手段也采用了计算机和CAD绘图技术，并与国外厂商开展合作设计。上海华东建筑设计院与外方共同设计中美上海施贵宝制药有限公司，上海医药设计院与外方共同设计中日天津大冢制药有限公司、中国瑞典无锡华瑞制药有限公司、中美苏州胶囊有限公司、中国比利时西安杨森制药有限公司、中日青岛华钟制药有限公司、中美大连辉瑞制药有限公司等。此外，上海市医药管理局设计室和上海第十六制药厂合作设计沪港上海万代制药有限公司。1990年，上海医药工程专业设计单位3个，设计人员805人，其中高级工程师187人，工程师502人，技术员67人，见习员49人。药厂有设计组(项目组)6个，人员47人。至1990年前的40年间，上海完成医药工程设计项目600余个，其中上海市100余个，外省市500余个，授外46个。